Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DNAJC4Q9NNZ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DNAJC4Q9NNZ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms