Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUFT1Q9NNX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUFT1Q9NNX1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms