Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVK-5Q9HDB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-5Q9HDB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-5Q9HDB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms