Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XAB2Q9HCS7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XAB2Q9HCS7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XAB2Q9HCS7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms