Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LIN28AQ9H9Z2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms