Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD3Q9H7E2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD3Q9H7E2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms