Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
YTHDC2Q9H6S0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
YTHDC2Q9H6S0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
YTHDC2Q9H6S0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
YTHDC2Q9H6S0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms