Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP4Q9H6H4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP4Q9H6H4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms