Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Y6

SRMS, Tyrosine-protein kinase Srms, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMSQ9H3Y6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMSQ9H3Y6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMSQ9H3Y6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRMSQ9H3Y6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms