Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG9Q9H0W8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG9Q9H0W8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMG9Q9H0W8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG9Q9H0W8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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