Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NBPF3Q9H094 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NBPF3Q9H094 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms