Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN7

ROGDI, Protein rogdi homolog, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDIQ9GZN7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ROGDIQ9GZN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ROGDIQ9GZN7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROGDIQ9GZN7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms