Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCSER1Q9C0I3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCSER1Q9C0I3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSER1Q9C0I3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms