Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZC3H12CQ9C0D7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZC3H12CQ9C0D7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZC3H12CQ9C0D7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms