Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PBDC1Q9BVG4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PBDC1Q9BVG4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PBDC1Q9BVG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms