Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C9orf16Q9BUW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf16Q9BUW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf16Q9BUW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms