Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFHD1Q9BUP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms