Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPK3BQ9BT76 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPK3BQ9BT76 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms