Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC77Q9BR77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms