Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FYCO1Q9BQS8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
FYCO1Q9BQS8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
FYCO1Q9BQS8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
FYCO1Q9BQS8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms