Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VGLL1Q99990 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VGLL1Q99990 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VGLL1Q99990 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms