Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDCA3Q99618 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA3Q99618 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms