Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCT8L2Q96SF2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCT8L2Q96SF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8L2Q96SF2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms