Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UIMC1Q96RL1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UIMC1Q96RL1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UIMC1Q96RL1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UIMC1Q96RL1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms