Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A9Q96Q91 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A9Q96Q91 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A9Q96Q91 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC4A9Q96Q91 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC4A9Q96Q91 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms