Protein–RNA interactions for Protein: Q96PY6

NEK1, Serine/threonine-protein kinase Nek1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1Q96PY6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEK1Q96PY6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK1Q96PY6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK1Q96PY6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms