Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM3Q96PE6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZIM3Q96PE6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZIM3Q96PE6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms