Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JSRP1Q96MG2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
JSRP1Q96MG2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JSRP1Q96MG2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms