Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf72Q96LT7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf72Q96LT7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf72Q96LT7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms