Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM47Q96LD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM47Q96LD4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM47Q96LD4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM47Q96LD4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms