Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNDP1Q96KN2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNDP1Q96KN2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNDP1Q96KN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms