Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COX4I2Q96KJ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms