Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITCHQ96J02 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITCHQ96J02 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 806 ms