Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHDQ96IW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHDQ96IW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHDQ96IW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms