Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT43Q96FT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT43Q96FT9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT43Q96FT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms