Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC10A4Q96EP9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC10A4Q96EP9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC10A4Q96EP9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC10A4Q96EP9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC10A4Q96EP9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC10A4Q96EP9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC10A4Q96EP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms