Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHFRQ96EP1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHFRQ96EP1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHFRQ96EP1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms