Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXorf40BQ96DE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXorf40BQ96DE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXorf40BQ96DE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms