Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF653Q96CK0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF653Q96CK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF653Q96CK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms