Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM43Q96BQ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM43Q96BQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms