Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VTI1AQ96AJ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTI1AQ96AJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTI1AQ96AJ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTI1AQ96AJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTI1AQ96AJ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VTI1AQ96AJ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms