Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA10Q969M2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA10Q969M2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJA10Q969M2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA10Q969M2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms