Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHC3Q92529 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHC3Q92529 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHC3Q92529 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms