Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HERVK_113Q902F9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERVK_113Q902F9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113Q902F9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERVK_113Q902F9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms