Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DNAAF4Q8WXU2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DNAAF4Q8WXU2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DNAAF4Q8WXU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DNAAF4Q8WXU2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DNAAF4Q8WXU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms