Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASKIN2Q8WXE0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASKIN2Q8WXE0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms