Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCG3Q8WXD2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCG3Q8WXD2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCG3Q8WXD2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms