Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBLCP1Q8WVY7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBLCP1Q8WVY7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBLCP1Q8WVY7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms