Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRNP27Q8WVK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP27Q8WVK2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP27Q8WVK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms