Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FNIP1Q8TF40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNIP1Q8TF40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNIP1Q8TF40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNIP1Q8TF40 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms